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  • 如何优雅地展示群落微生物数据

    这种circos图常见于16s等扩增子测序分析文章中,样本中包含哪些微生物是我们群落研究的第一个问题,circos图以圆的形式将样本和物种信息列在两侧,通过内部的连线表示对应关系,让样本中的物种组成关系…

    昨天 18:00 0 0
  • 写文章卡在作图上了,怎么办?

    “好钢使在刀刃上”,科研工作者的精力应该主要放在科研成果产出上。当你还在网上繁杂的信息中摸石头过河时,别人Nature都发了…… 为了有效减少大家网上找资料、自己摸索所花费的大量时间精力, 《生物信息实用…

    前天 17:59 0 0
  • 写文章卡在作图上了,怎么办?

    为了有效减少大家网上找资料、自己摸索所花费的大量时间精力, 《生物信息实用工具与教程III》介绍了基迪奥摸索过的那些实用生信工具,“顺带”展示了一些数据处理的“ 骚操作”,内容丰富,干货实用,适合农医科…

    2天前 0 0
  • 风很大的10x genomics到底能发怎样的文章?

    以下是2017年以来到2020年5月,每个季度10x genomics技术发表论文的数量,基本处于加速增长的趋势,并且正在渗透到很多原来单细胞技术没有涉及的研究领域。因为10X genomics是单细胞领域目…

    3天前 0 0
  • 一睹为快!传说中的“骚操作”教程书长啥样

    所以当最新印刷好的《生物信息实用工具与教程III》从印厂出炉,小奥一拿到手就赶紧拍了几张美图,给大家解解馋! 只要您关注了基迪奥微信公众号,并扫码填写您的真实意向,就可以获赠本书 。 Tip:意向信…

    3天前 0 0
  • 新书终于到手啦!!

    本书的内容是全新的,与工具书I、工具书Ⅱ在内容上互为补充,下面来了解一下它含括了哪些内容吧! Tip:意向信息越真实明确,越容易获得本书哦。填写意向后五个工作日内会有工作人员与您联系确认您的意向,如果一…

    4天前 0 0 科研
  • 便利的R包在你进行差异分析的时候帮你做了什么

    TMM标准化的过程,是先过滤掉count值为0和异常样本,以参考样本的基因作为标准,对其他基因表达量进行校正。上一步是样本和参考样本相除的结果,这一步是计算两个样本基因表达量相乘再取log2,然后除以2…

    05-20 18:12 0 0
  • 推荐一款“性冷淡风”的序列展示工具

    你还可以通过Edit菜单用鼠标点选自己想展示的区域(Blocks),如我这里选择前两段(Blocks),然后Copy Selected Blocks to MetaFile(实际上就是Ctrl+C复制一下),…

    05-19 18:05 0 0
  • 高分期刊中频频登场的VPA分析到底是啥?

    使用VPA分析的思想,将两个环境因子的数据各自独立运行RDA分析(RDA简单说明:所有标准化后的解释变量对响应变量逐一进行多元回归分析,获得拟合值、残差值,最终整合成为拟合值矩阵,该矩阵进行PCA、排序得分分…

    05-15 18:14 0 0
  • “老数据新用”,基迪奥助力科研抗疫

    注意 2. 若签单金额低于以上三种赠送方式的最低限度,将赠送基迪奥原创书藉任意2本(6选2),签单5万以上的可以额外赠送基迪奥原创书藉一套(6本);…

    05-13 18:10 0 0
  • 一年发6篇SCI,平均影响因子5.7 ,怎么做到的?

    从 实验设计到 数据挖掘、 撰写文章,基迪奥合作客户亲历讲解;一年发表6篇SCI的神仙嘉宾、发表平均影响因子6.05分的神仙嘉宾,功能实验特别厉害又会讲生物学故事的中国海洋大学青椒耶鲁博后独家开播…

    05-11 18:20 0 0 设计
  • 测序数据上传NCBI怎么又报错了?

    我们挑选可用的ID后,一般在文献的材料方法部分指明将原始测序数据(raw sequence data)上传在了NCBI的SRA数据库(图1)。 Tips 数据上传会遇到一些问题,如果自己解决不了,可以直接…

    05-09 18:13 0 0 ICO 基因 微生物
  • 基迪奥文章产出大讲堂火热开播!

    从 实验设计到 数据挖掘、 撰写文章,基迪奥合作客户亲历讲解;一年发表6篇SCI的神仙嘉宾、发表平均影响因子6.05分的神仙嘉宾,功能实验特别厉害又会讲生物学故事的中国海洋大学青椒耶鲁博后独家开播,…

    05-08 18:13 0 0 设计
  • 别搜啦!关于富集分析你想知道的这里都有!

    它的统计原理是用超几何分布型来检验一组基因(共表达或差异表达)中某个功能类的显著性,通过离散分布的显著性分析、富集度分析和假阳性分析, 得出与实验目的有显著关联的、低假阳性率的及靶向性的基因功能类别。 对…

    05-07 18:21 0 0
  • “老数据新用”,基迪奥助力科研抗疫

    为了回馈基迪奥的老客户,从即日起, 老客户介绍新客户签单成功,老客户将获得丰厚礼品! 2. 若签单金额低于以上三种赠送方式的最低限度,将赠送基迪奥原创书藉任意2本(6选2),签单5万以上的可以额外赠送基迪…

    04-28 18:26 0 0
  • 10分微生物物种分析文章是怎样炼成的

    如图2,为了找到可以指示珊瑚生态系统环境压力变化的微生物,研究首先针对珊瑚的生态系统,从空间尺度选择了与珊瑚密切关联的9种生境类型(图1),并对样本进行了多种环境因子的检测。 考虑到温度是对珊瑚健康…

    04-28 18:26 0 0

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